1、招生外包
       云南省教育厅关于进一步规范普通高中招生行为的通知》（云教基【2017】4号）文件中，明确指出："任何单位和个人不得有偿为招生学校介绍生源和组织报名。"而建水实验中学却从建校之初到现在为止，每一年都在违规招生，买卖初高中生源，扰乱云南省的初高中招生。
       每逢招生季，建水实验中学均与为云南省大中专、技校招生的社会人员联系，双方达成约定，建水实验中学将某个州市外包给某个招生团队，待学生入学后，按约定给予招生返点。一般为6000-10000元/生，且分几次发支付，学生入学后发放一部分提成，三个月以后在发放剩余部分提成。
       2、高价买卖学生
       建水实验中学专门安排人员到各学校物色成绩较好的高三学生，再通过不为人知的方式获取家长联系方式后，花钱高价买学生到学校就读，待学生高考后，用学生的成绩及录取学校做宣传。为让某个学生到他们学校摆摆样子就读三个月，甚至出价50万，不明真相或被金钱迷惑的学生及家长就这样被"买卖"。
       3、建水实验中学未经验收就投入使用，建筑存安全隐患却已使用近三年
       四川同程建设有限公司（以下简称同程公司）云南建水实验中学一期项目部经理涂飞向西南商报投诉称，他们修建的云南建水实验中学未经验收就投入使用，存在极大安全隐患。
       涂先生介绍，2014年2月前后，经朋友介绍，同程公司与云南普惠投资有限公司（以下简称普惠公司）法定代表人杨易磋商云南建水实验中学项目工程合作事宜。期间，杨易声称其与云南省、红河州、建水县等政府有特殊关系，能够低价甚至免费拿到一千多亩土地用于建设云南建水实验中学，且能在学校建成之前拿到招生指标，能确保项目赚钱，希望同程公司垫资修建云南建水实验中学项目工程。
       然而，普惠公司在工程投入使用后，一直不与同程公司进行竣工结算。同程公司多次与普惠公司协商无果，导致同程公司无法支付部分民工工资和供应商材料款。时至今日，民工和材料商经常到同程公司索要工资、材料款，致使同程公司无法正常经营。
       此外，同程公司还向媒体投诉了建水实验中学一期项目未经过招投标；项目未经过建设主管部门报批立项；施工图纸未经过主管部门审查；建设用地未经过招拍挂程序；私自将隔震层升高一米；房屋未经过验收就投入教学使用；政府用公租房资金为民营学校学生宿舍买单等问题。
       4、虚假宣传，违规承诺
       每一年都有多名学生反映，建水实验中学对外宣称是昆明某学校的建水分校，但实际并无关联，就靠这样的虚假宣传还是误导了很多学生家长，这些家长发现猫腻后质问学校，学校就让学生转学，控制事态。
       建水实验中学在招生宣传过程中，还承诺学生就读三年后包上一本二本等，还签订包上大学的协议，实际，只是在玩概率，目的是迅速聚集资金，填补财务漏洞。
       5、官司缠身，疲于奔命
       据知情人士透露，建水实验中学从去年开始，就开始出现大量学生转学、退学情况。另外，校园建设经济纠纷、外包招生团队纠纷、内部拖欠教师工资纠纷等等，众说纷纭。
       6、学生成绩低下，经常打群架、抽烟、但是学校放任不管。